Für Biogas-BHKWs werden primär zwei Katalysatortypen eingesetzt: Oxidationskatalysatoren zur Reduzierung von Formaldehyd und Kohlenmonoxid (CO) sowie SCR-Katalysatoren, falls eine drastische Absenkung der Stickoxide (NOx) gefordert ist. Da Biogas häufig Spuren von Schwefelwasserstoff und Siloxanen enthält, müssen die eingesetzten Katalysatoren besonders robust ausgelegt oder durch entsprechende Gasreinigungssysteme (Aktivkohlefilter) im Vorfeld geschützt werden.